A chili és a jellegzetes hatóanyaga - a kapszaicin - gasztritisz és peptikus fekély elleni védő aktivitását számos tanulmány bizonyította, azzal a feltétellel, hogy a kapszaicin aszpirinnal és másokkal való társítását jelenleg vizsgálják. A nem szteroid gyulladáscsökkentők csökkentik ezen gyógyszerek káros hatásait a gyomor nyálkahártyájára.
Egyes kutatások arra utalnak, hogy a kapszaicinnek is van antimikrobiális hatása a Helicobacter pylori baktériummal szemben, amely a peptikus fekély és a krónikus gyomorhurut fő oka az emberben. Ezt a aktivitást a metronidazolra rezisztens Helicobacter pylori törzsek esetében is kimutatták, és összhangban van egyes epidemiológiai vizsgálatok eredményeivel; a statisztikák azt mutatják, hogy bizonyos populációkban, ahol széles körben használják a paprikát, a gyomorfekély előfordulása alacsonyabb.
Az in vitro vizsgálatokban vizsgált koncentrációk alapján a Helicobacter pylori elleni antibiotikus hatások elérése érdekében a forró paprika bevitelének konzisztensnek kell lennie (naponta 3–9 nyers paprikát, a kapszaicin tartalmától függően); meg kell azonban határozni, hogy a kapszaicin mellett a chili paprikában jelenlévő egyéb anyagok (fitokomplex) szinergikus hatást fejthetnek ki, csökkentve a minimális hatásos dózist. Továbbá, a gyomor természetes veleszületett védelmével való szinergia tovább csökkentheti a chili dózisát, amely elegendő ahhoz, hogy a Helicobacter pylori- t a gyomor környezetéből megszüntesse.
Egy friss áttekintés a chili fogyasztás és a gyomorrák közötti kapcsolatról (amelyre nézve ellentmondásos tanulmányok) a kapszaicin-bevitel mérséklését javasolja, hogy teljes mértékben élvezze a potenciális előnyök kockázatát. A meghívás azonban különösen érvényes azokra a populációkra (például a mexikói), ahol a chili paprika szokásos fogyasztása és a kapszaicin koncentrációja a felhasznált fajtákban egyértelműen magasabb, mint az olasz szokások.
