Immunkompetenseknél általában nincs szükség specifikus toxoplazmózis kezelésre. A betegség szinte mindig spontán megoldódik néhány hónapon belül; ha szükséges, tüneti terápiákat lehet alkalmazni.
Az immunodepressziós egyénekben és veleszületett formákban viszont a pirimetamin és szulfadiazin kombinációjával folinsavval (azaz 5-metil-tetrahidrofoláttal: tetrahidrofoláttá átalakított és metilcsoporttal hozzáadott folsav) történő kezelést jelezzük. a folátokkal (beleértve a myelosuppressziót is) való antagonizmus által okozott károk kockázata. Továbbá, kortikoszteroidokat kell adni a szemészeti toxoplazmózisban szenvedő betegeknek.
Ami az elsődleges fertőzésű terhes nőt illeti, az antibiotikum-kezelés csökkentheti a magzati károsodás kockázatát. Különösen a spiramicint írják elő, ha a toxoplazmózist az első trimeszterben (jól tolerálható és a magzatra nem toxikus, mivel nem lép át a placentán) vagy szulfadiazin, pirimetamin és folinsav kombinációjával kötötték. Ez az utolsó terápiás rendszer elméletileg hatékonyabb, ha a magzat már fertőzött, de mérgezőbb (a pirimetamin nem alkalmazható az első trimeszterben, mivel teratogén). Ezt a kezelést ezért szigorú orvosi felügyelet mellett kell elvégezni, és a vérszám folyamatos ellenőrzését igényli.
