Az Ebola- vírus eredete nem ismert, de a rendelkezésre álló bizonyítékok alapján a gyümölcstollat a kórokozó természetes tartályának tekintik.
Gyümölcs denevérek, amelyek jobban ismertek, mint a rókák, a nagy erdők, amelyek a folyami erdőkben élnek. Legalább három egészséges vírust hordozó denevérfaj ismert (az Ebola nem okoz tüneteket ebben az állatban): a kalapácsfejű denevér (Hypsignathus monstrosus), a Franquet epaulettjei (Epomops franqueti) és a gyümölcs denevér. a gallérból (Myonycteris torquata).
De hogyan jutott el a fertőzés az állatoktól az emberekhez? Afrika népének polgári háborús évek veteránjai a denevérek táplálékforrása. Nem csak ezt. Nyugat- és kínai vállalatok, amelyek az erdőirtáshoz és az ásványi anyagok kereséséhez a dzsungelbe lépnek, növelték a bokorhús gyakorlatát, azaz a vadon élő állatokból származó hús kereskedelmét és fogyasztását. A férfiak ezért a denevérekkel fertőzött antilopokat vagy csimpánzokat ( közbenső gazdaszervezetek ), az Ebola vírussal szerződhetnek, és elterjedhetik a fertőzést.