Az egyéni védőintézkedések és a hordozó környezetvédelmi ellenőrzése mellett a japán encephalitis megelőzhető vakcinázással.
Az Ixiaro vakcina, amelyet az FDA (Food and Drug Administration) már jóváhagyott az Egyesült Államokban és amelyet az EMEA (Európai Gyógyszerügynökség) engedélyezett, intramuszkulárisan adnak be a deltoid régióba (felkar), két adagban, a második adagban. amelyet az első után 4 héttel beoltunk. A jó aktív immunizálás érdekében a vakcinázást legalább egy héttel a japán encephalitis vírussal való esetleges érintkezés előtt kell befejezni.
A japán encephalitis vakcinát olyan utazóknak ajánljuk, akik hosszú ideig tartózkodnak szabadban endemikus területeken, azon időszak alatt, amikor a fertőzés átvitele a legvalószínűbb; ez azonban nem javasolt 18 év alatti személyek számára, terhesség alatt és szoptatás alatt.
