A toxoplazmózis magzatra történő átvitelének valószínűsége a terhesség időtartamától függően változik, amikor az anya megbetegedett a fertőzéssel: a kockázat a terhesség elején alacsony és az idő előrehaladtával nő. Éppen ellenkezőleg, a gyermek által jelentett károsodás súlyossága nagyobb, amint az anyai-magzati átvitel történik. A terhesség hatodik hónapjában bekövetkezett fertőzés esetén a spontán abortusz, a koraszülés vagy a születési magzat chorioretinitist, hidrokefáliát (vagy mikrocefáliát) és intrakraniális meszesedést okozhat. Ezek a neurológiai tünetek összefügghetnek a bőr kitörésével, a látóideg atrófiájával, a nystagmussal, a sárgasággal, a myocarditisgel és a tüdőgyulladással.
A Toxo tesztben valószínűsíthető és megállapított anyai toxoplazmózis esetén, hogy tudjuk-e, hogy a Toxoplasma gondii valóban átlépte-e a placentán lévő gátat, és fertőzött-e, a gyermek jelzi az amniocentézis végrehajtását (nem a 15. terhességi hét előtt). A vizsgálat során vett és a PCR (polimeráz láncreakció) alá tartozó amnion folyadék mintája lehetővé teszi a parazita DNS lehetséges jelenlétének megerősítését, ezáltal diagnosztizálva a magzati fertőzést. Másrészt az echográfiai megfigyelés egyértelmű magzati károsodás jeleit mutathatja (intrakraniális meszesedés, hidrocefalusz, hepatomegalia, intrauterin növekedési késleltetés). A születést követően a veleszületett toxoplazmózis gyanúját alapvetően a szerológiai vizsgálatok és a betegség jeleinek jelenléte határozza meg, amelyek még évekkel később is megjelenhetnek, különösen a kezelés hiányában.
