A Marburg- vírus nevét ugyanabból a német városból kapta, ahol először 1967-ben jelent meg, amikor három egyidejű kitörést okozott Németországban (Marburg és Frankfurt városai) és a volt Jugoszláviában (Belgrád). Mindkét országban a Marburg-vírust valószínűleg ugandai zöld majmok ( Cercopithecus aethiops, más néven Grey-green Cercopiteco) behozatalával vezették be.
Az első eseteket a laboratórium munkatársai közé sorolták, akik szoros kapcsolatban álltak a főemlősökkel. A másodlagos esetekben a kórházak fertőzött biológiai anyagnak kitett orvosi személyzet állt.
Ezt követően sporadikus epizódokat vagy járványokat észleltek Dél-Afrikában, Kenyában, a Kongói Demokratikus Köztársaságban és Angolában, összesen mintegy 600 esetben és 480 halálesetben.
